Каменный храм был построен на средства прихожан в 1812 году. До этого с 1766 года здесь была деревянная церковь. С её появлением Пупково стало селом, а приход охватывал ещё 19 деревень по округе.
В 1938 году церковь закрыли. Со временем многочисленные поселения в окрестностях храма опустели, так же, как и село Пупково. Сейчас никаких построек в нём не сохранилось.
Согласно описанию доктора архитектуры А.В. Лисицыной, Преображенская церковь – характерный образец сельского каменного храма в формах раннего классицизма с отдельными элементами провинциального барокко.
Многие знали про эту церковь, останавливались, проезжая мимо, чтобы взглянуть на постепенно разрушающееся здание. Для всех это печальное зрелище, результат перемен, которые произошли в жизни общества за последнее столетие.
Одним из таких проезжающих людей был Александр – предприниматель из Заволжья. Он и ещё несколько человек решили не оставлять храм разрушаться, а сделать что-то для спасения памятника архитектуры.
На территории храма было организовано несколько субботников. В августе в рамках проекта «Добровольцы Росатома – культурному наследию России» прилегающая территория была очищена от мусора, поломанных ветвей и т.д. В субботнике приняли участие около 70 человек.
Продолжили это дело в сентябре студенты Городецкого губернского колледжа, проведя у храма два субботника. Были и другие акции.
Кроме прочего волонтёры спилили много сорных деревьев. Таким образом с дороги открылся вид на храм. Организаторам удалось найти спонсоров для консервации церкви. Был привезён пиломатериал, начались работы. Привлечённый для них подрядчик уже имеет опыт консервации храмов. Специалисты знают, как сделать это правильно.
Многие проезжающие мимо стали останавливаться и интересоваться происходящим, а некоторые – предлагать свою помощь. Подключилось и несколько жителей близлежащих населённых пунктов. Организаторы мероприятия не ожидали такого живого отклика на их инициативу. При этом они не собираются останавливаться и уже думают о том, как сделать проект реставрации церкви, а затем и осуществить его.
В середине октября на ведущиеся здесь работы по спасению храма приехал взглянуть епископ Городецкий и Ветлужский Парамон.
Владыка посетил также аварийный храм Спаса Неруко-творного Образа в д. Конево, где тоже проходят консервационные работы.